IT之家 12 月 21 日消息，近日，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所茶樹遺傳育種團隊基于“龍井 43”基因組參考序列和茶樹重測序數(shù)據(jù)，開發(fā)出一款 200K 茶樹 SNP 芯片。相關(guān)研究成果在《植物生物技術(shù)雜志（Plant Biotechnology Journal）》上發(fā)表。
該芯片是首款茶樹高密度 SNP 芯片，以“龍井 43”（雌性）和“白毫早”（雄性）F1 群體為材料，該芯片能夠?qū)?18226 個 SNP 位點繪入圖譜，獲得 5325 個 bin-marker，連鎖圖譜總長度為 2107.01 厘摩，相鄰標記平均遺傳圖距為 0.39 厘摩，構(gòu)建了目前遺傳密度最高的連鎖圖譜。
實驗驗證表明，該芯片可以有效定位關(guān)鍵 QTL 位點，發(fā)掘茶樹重要功能基因。利用其對不同茶樹品種的 SNP 分型研究，發(fā)現(xiàn)茶樹大葉種和小葉種之間的兩個強選擇位點，對揭示茶樹品質(zhì)調(diào)控關(guān)鍵基因和兩個變種間的進化關(guān)系具有重要意義。
IT之家獲悉，該研究得到國家重點研發(fā)項目、中國農(nóng)科院科技創(chuàng)新工程、國家自然科學(xué)基金等項目的支持。
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