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華為:昇思 MindSpore 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)模型超越 AlphaFold2,拿下全球競(jìng)賽第一

2022/4/23 15:51:38 來(lái)源:IT之家 作者:長(zhǎng)河 責(zé)編:長(zhǎng)河

IT之家 4 月 23 日消息,據(jù)華為官網(wǎng),基于全場(chǎng)景 AI 框架昇思 MindSpore 開發(fā)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)模型近期在全球持續(xù)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)競(jìng)賽 CAMEO(Continous Automated Model EvaluatiOn)獲得全球第一的成績(jī)。

華為

2020 年 12 月,《科學(xué)》雜志評(píng)選了該年度十個(gè)重大科學(xué)突破,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的人工智能 AlphaFold 就是其中非常重要的一項(xiàng)。

據(jù)介紹,2021 年 11 月,華為昇思 MindSpore 團(tuán)隊(duì)與昌平實(shí)驗(yàn)室、北京大學(xué)生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心(BIOPIC)和化學(xué)與分子工程學(xué)院、深圳灣實(shí)驗(yàn)室高毅勤教授課題組聯(lián)合推出基于 AlphaFold2 算法的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)推理工具,并在 2022 年 2 月實(shí)現(xiàn)訓(xùn)練的全流程打通,效率同比提升 2-3 倍。

IT之家了解到,華為表示,采用昇騰 AI 基礎(chǔ)軟硬件平臺(tái)后,在混合精度下,單步迭代時(shí)間由 20 秒縮短到 12 秒,性能提升超過 60%。依托昇思 MindSpore 內(nèi)存復(fù)用能力,訓(xùn)練序列長(zhǎng)度由 384 提升至 512

4 月 21 日最新月榜競(jìng)賽結(jié)果

▲ 4 月 21 日最新月榜競(jìng)賽結(jié)果 | 圖源:華為

在訓(xùn)練精度接近 AlphaFold2 的基礎(chǔ)上,昇思 MindSpore 在算法、規(guī)模和軟硬件支持等方向上持續(xù)改進(jìn),本次發(fā)布的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)模型成績(jī)持續(xù)刷新業(yè)界記錄、拿下 CAMEO 競(jìng)賽第一。CAMEO 被認(rèn)為是蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)領(lǐng)域最重要的比賽之一,競(jìng)賽規(guī)則是,每位參賽者需每周對(duì) 20 個(gè)由世界范圍內(nèi)的結(jié)構(gòu)生物學(xué)家最新破解出的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè),其分?jǐn)?shù)和名次每周都會(huì)進(jìn)行在線更新。

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