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DeepMind 推出 AI 工具 Alpha Missense,用于預(yù)測人類的有害基因突變

2023/9/20 9:34:24 來源:IT之家 作者:漾仔(實習(xí)) 責(zé)編:漾仔
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IT之家 9 月 20 日消息,谷歌旗下 DeepMind 日前推出了名為 AlphaMissense 的 AI 工具,其中評估了所有 7100 萬個“錯義”突變,IT之家經(jīng)過查詢得知,該工具已經(jīng)上架 GitHub,研究結(jié)果日前也已經(jīng)發(fā)表在《科學(xué)》雜志上。

▲ 圖源 相關(guān)論文

據(jù)悉,人類專家迄今只發(fā)現(xiàn)了 0.1% 的錯義變體的臨床影響,這些變體改變了人體主要工作分子 (蛋白質(zhì)) 的結(jié)構(gòu)。在這些突變中,人類遺傳密碼中的一個字母發(fā)生了變化。其中 32% 被歸類為可能致病,57% 為良性,其余不確定。

AlphaMissense 預(yù)測顯示了兩種蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的突變,其中紅色為有害,藍(lán)色為良性,灰色為不確定。

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▲ 圖源 相關(guān)論文

DeepMind 倫敦總部的項目研究員 ?iga Avsec 聲稱:“此前發(fā)現(xiàn)致病變異的實驗既昂貴又費力,每種蛋白質(zhì)都是獨一無二的,每個實驗都必須單獨設(shè)計,這可能需要幾個月的時間。而現(xiàn)在通過使用 AI 預(yù)測,研究人員可以一次預(yù)覽數(shù)千種蛋白質(zhì)的結(jié)果,這有助于確定資源的優(yōu)先次序,加快更復(fù)雜的研究?!?/p>

?iga Avsec 同時表示,當(dāng)前 AlphaMissense 也有局限性,該工具對致病性的預(yù)測并不能告訴研究人員“變異體的生物物理性質(zhì)”,不過他依然對該工具的前景表示樂觀。

同為該項目的研究人員程俊表示,“這些 AI 預(yù)測從未真正打算單獨用于臨床診斷,它們應(yīng)該始終與其他證據(jù)一起使用,不過這些預(yù)測依然將有助于提高罕見病的診斷率,也能夠幫助研究人員找到新的致病基因。”

參考

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關(guān)鍵詞:deepmindAI,科學(xué)

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