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OpenAI GPT-4 AI 模型潛力挖掘:高精度建?;A(chǔ)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)

2024/8/22 8:40:27 來源:IT之家 作者:故淵 責編:故淵

IT之家 8 月 22 日消息,科技媒體 The Decoder 昨日(8 月 21 日)發(fā)布博文,報道稱羅格斯大學的一項研究表明,OpenAI 公司的 GPT-4 語言模型能高精度模擬簡單的氨基酸和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。

相關(guān)研究成果發(fā)表在《Scientific Reports》上,該科研團隊使用 GPT-4 AI 語言模型,探索其在基本結(jié)構(gòu)生物學任務(wù)中的表現(xiàn),結(jié)果發(fā)現(xiàn)該 AI 模型可以準確預(yù)測分子結(jié)構(gòu)。

科學家們要求 GPT-4 建立 20 種標準氨基酸的三維結(jié)構(gòu)模型,在反饋結(jié)果中準確地預(yù)測了原子組成、鍵長和角度,不過 GPT-4 在模擬環(huán)狀結(jié)構(gòu)和立體化學構(gòu)型時卻出現(xiàn)了錯誤。

在另一項實驗中,GPT-4 被要求模擬常見的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)元素--α-螺旋的結(jié)構(gòu),需要集成 Wolfram 插件進行數(shù)學計算,結(jié)果模型與實驗確定的 α-螺旋結(jié)構(gòu)相當。

此外,GPT-4 還分析了抗病毒藥物 Nirmatrelvir 與 SARS-CoV-2 主要蛋白酶之間的結(jié)合。該模型正確識別了參與結(jié)合的氨基酸,并準確指定了相互作用原子之間的距離。

由于 GPT-4 并不是專門為結(jié)構(gòu)生物學任務(wù)開發(fā)的,因此這些能力非常突出。研究人員指出,GPT-4 的建模方法尚不明確。它可以使用訓練數(shù)據(jù)集中的現(xiàn)有原子坐標,也可以從頭開始重新計算結(jié)構(gòu)--要得出明確的結(jié)論,還需要進一步的廣泛研究。

研究人員表示,AlphaFold 3 等專用人工智能工具可以預(yù)測更復(fù)雜的結(jié)構(gòu),而 GPT-4 則有望完成基本的結(jié)構(gòu)生物學任務(wù)。這種建模能力目前還很初級,實際應(yīng)用有限。

盡管如此,研究小組表示,這項研究開創(chuàng)了將這種技術(shù)應(yīng)用于結(jié)構(gòu)生物學的先例。研究人員建議進一步研究生成式人工智能的能力和局限性,可以在結(jié)構(gòu)生物學領(lǐng)域之外,進一步探索 AI 在其他潛在的生命科學領(lǐng)域的應(yīng)用。

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