IT之家 12 月 26 日消息，九江市農(nóng)業(yè)科學(xué)院于 12 月 24 日發(fā)布博文，宣布以第一署名單位聯(lián)合中山大學(xué)、江西省瑞昌長(zhǎng)江四大家魚(yú)原種場(chǎng)，首次完成并發(fā)布長(zhǎng)江流域極危物種“鳤（IT之家備注讀音：guǎn）”高質(zhì)量染色體水平基因組。
鳤曾是我國(guó)重要的淡水經(jīng)濟(jì)魚(yú)類，廣泛分布于長(zhǎng)江流域，然而，由于環(huán)境惡化和人類活動(dòng)的影響，數(shù)量急劇下降，在《中國(guó)脊椎動(dòng)物紅色名錄》和《中國(guó)生物多樣性紅色名錄 — 脊椎動(dòng)物卷》中均被列為極危（CR），2020 年 12 月在長(zhǎng)江公安江段監(jiān)測(cè)到了 7 尾鳤，是近年野外調(diào)查發(fā)現(xiàn)最多的一次，迫切需要對(duì)其開(kāi)展保護(hù)。
鳤基因組信息的缺乏是保護(hù)工作的重大障礙之一，為進(jìn)一步挖掘其種質(zhì)資源特征，團(tuán)隊(duì)成員利用 PacBio 和 Hi-C 測(cè)序數(shù)據(jù)組裝了鳤染色體級(jí)別的基因組，大小為 883.1 Mb，包含 24 條假染色體，Scaffold N50 長(zhǎng)度為 35.1 Mb，配合轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)預(yù)測(cè)了 28674 個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因，并已將組裝和注釋數(shù)據(jù)公布到 GenBank 和 Figshare 數(shù)據(jù)庫(kù)。
論文共同通訊作者盧建國(guó)表示：“鳤基因組信息的首次發(fā)布對(duì)于理解遺傳多樣性、識(shí)別獨(dú)特適應(yīng)性以及制定有效的保護(hù)策略至關(guān)重要”。
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